Python Visual1:PyGMT使用

1. 安装 1.1 准备 1.2 官网安装 1.2 启动虚拟环境 1.3 测试 1.4 例子 2. 安装jupyterlab 2.1 启动 2.2 配置虚拟环境 2.3 启动jupyterlab

1. 安装

在安装PyGMT之前，必须要安装GMT本身以及其他依赖项。最简单的方法就是使用conda包管理器，建议在隔离的conda虚拟环境中进行，以免其依赖项与其他python的依赖项版本互相干扰或矛盾。

1.1 准备

minconda3

参考：
Python Notes22:Anaconda、Miniconda

1.2 官网安装

The sections below provide more detailed, step by step instructions to install and test PyGMT for those who may have a slightly different setup or want to install the latest development version.

https://www.pygmt.org/latest/install.html


conda create --name pygmt --channel conda-forge pygmt

1.2 启动虚拟环境


conda activate pygmt

1.3 测试

test.py


import pygmt
pygmt.show_versions()

1.4 例子

D:\Cumtb_Code\pygmtdemo\demo.py


import pygmt

# 创建一个绘图实例 
fig = pygmt.Figure()
# 绘制basemap
fig.basemap(region=[-90, -70, 0, 20], projection="M8i", frame=True)
# 绘制海岸线
fig.coast(shorelines=True)
# 显示图形
fig.show()

虚拟环境下运行


# 进入虚拟环境
conda activate D:\Cumtb_Code\pygmt

# 运行例子
(D:\Cumtb_Code\pygmt) D:\Cumtb_Code\pygmtdemo>python demo.py

会自动打开pdf，体验不太友好。

2. 安装jupyterlab


conda install jupyterlab

2.1 启动


jupyter lab

浏览器中显示

这样打开没有虚拟环境

2.2 配置虚拟环境


(D:\Cumtb_Code\pygmt) D:\Cumtb_Code>conda install ipykernel

使用ipykernel（在pygmt安装）


python -m ipykernel install --user --name pygmt --display-name="pygmt-kernel"

参数含义：其中，–user表示仅为用户安装kernel，–name后空格跟需要安装的虚拟环境的名字，—display-name后空格跟英文引号闭合的字符串，为显示的时的名字。

创建ipykernel的文件的位置在这儿，不需要的话可以直接删除。

2.3 启动jupyterlab

在虚拟环境下启动（我们在D:\Cumtb_Code\pygmt虚拟环境下安装了相关的库）


(D:\Cumtb_Code\pygmt) D:\Cumtb_Code>jupyter lab

测试例子


import pygmt

# 创建一个绘图实例 
fig = pygmt.Figure()
# 绘制basemap
fig.basemap(region=[-90, -70, 0, 20], projection="M8i", frame=True)
# 绘制海岸线
fig.coast(shorelines=True)
# 显示图形
fig.show()

成功显示